L'Ufficio coordina le attività della Protezione Civile regionale finanziate con Fondi Strutturali e di Investimento europeo, (es. POR Puglia FESR/FSE 2014-2020) – ed è responsabile per il monitoraggio e la gestione degli interventi delegati.

L'Ufficio è inoltre delegato per la gestione di diversi progetti di Cooperazione Territoriale Europea (es. Interreg, ecc..) orientati a rafforzare la collaborazione nel campo della Protezione Civile (nel rispetto delle regole previste dall' EU Civil Protection Mechanism) in particolar modo con i Paesi transfrontalieri (Albania, Montenegro, Croazia, Grecia).